El proceso de extracción de etanol - destilación, fortalecimiento y purificación de etanol de impurezas - rectificación se implementa en instalaciones que consisten en dos o más aparatos de columna (dependiendo del tipo de etanol producido). Las columnas de separación funcionan bajo sobrepresión y vacío, lo que garantiza la más completa recuperación de calor de los vapores de agua y alcohol.
A la salida del departamento se forma una línea de productos comerciales: alcohol etílico, rectificado con una graduación de 96,3% vol., aceite de fusel, FGES.
Los principales residuos del departamento: vinazas post-alcohol, aguas de luther.