Основне призначення антисептика - боротьба з патогенною мікрофлорою. У сучасних умовах для боротьби використовують спирти та їх суміші (етиловий, пропіловий, ізопропіловий), солі різних хімічних речовин, борну кислоту, ЧАС (четвертинні амонієві сполуки), розчин йоду і т.д. Дієвим засобом гноблення патогенної мікрофлори є антибіотики.
У виробництві етанолу використання антибактеріальних засобів набуло широкого застосування, так як «чистота» процесу відіграє важливу роль в досягненні оптимальних умов життєдіяльності дріжджів, забезпечуючи без втрат перетворення крохмалю в етанол.