Очищенню зерна на заводах з виробництва етанолу приділяють особливу увагу. Механічні і особливо феромагнітні домішки впливають на стабільність проведення технологічного процесу і вихід готового продукту з одиниці сировини. Феромагнітні домішки істотно ускладнюють ведення технологічного процесу, потрапляючи в подрібнюючі (дробарки) і транспортуючі пристрої (норії, гвинтові конвеєри, насоси), що призводить до передчасного зносу устаткування і ненавмисним аварійним зупинкам виробництва.
Витяг феромагнітних домішок здійснюється за допомогою спеціальних пристроїв-сепараторів на постійних магнітах.